从厄普西隆元年到厄普西隆五年，并非完全的安定，其中有三年被用来进行战争，镇压抵抗力量。主要对象是苏维埃联盟和天蝎组织。
据心灵终结战争结束后统计，终结仪启动，残存的抵抗力量人数在七十五万左右。
终结仪启动之后，厄普西隆占领了整个苏俄，而在清点俘获人数时，塞缪尔发现少了雷泽诺夫和库可夫，为了巩固政权，塞缪尔开始对整个苏俄进行搜查。最终在厄普西隆元年四月份的时候，发现了位于东西伯利亚的苏军幸存者，大约有一万五千人左右，统帅正是雷泽诺夫和库可夫。塞缪尔亲率十万大军进行征讨，战事在六月底结束，地球上的苏俄部队彻底被消灭。但是令塞缪尔不安的是，清点战场的时候依然没有看到雷泽诺夫和库可夫的尸体，有可能是被炮弹炸的尸骨无存，也有可能是跑掉了。塞缪尔在内心更侧重于后者，他总感觉那两个人还活着。
随后就是对拉丁同盟的清剿。
在终结仪启动之后，美洲大陆的主要城市和八成以上的土地都落入了厄普西隆的手中，但仍然有一些拉丁同盟的幸存者遁入安第斯山，科迪勒拉山系，甚至是丛林之中进行游击抵抗。对拉丁同盟的清剿于厄普西隆元年五月开始，使用了南北美洲总异教的大量军队，总数在五十万左右，同时还调集了空中舰队，导弹舰艇和巡航导弹进行无差别时打击。在抵抗了八个月，也就是在厄普西隆二年三月底，拉丁同盟被基本肃清。厄普西隆统计，所消灭的拉丁同盟部队有八万之多，最后厄普西隆确定，拉丁同盟也被彻底消灭。当然，这是他们以为的。
最后是对华夏的进攻。