爱子爱妃的接连逝去，使顺治的精神几乎崩溃。他万念俱灰，看破红尘，弃江山社稷如敝履，执意要出家为僧，并让和尚溪森为他剃了发。后来由于溪森的师父玉林琇以要烧死溪森为要挟，才逼得福临打消了出家的念头。
不仅顺治如此哀恸，其他的人都一样悲痛不已。在她崩时，孝惠后和其他妃嫔都哭嚎：“与其留下我们这些没用的人，还不如存留下贤淑的皇贵妃啊，能够符合皇上的心意啊！我们这些怎么不也先后死去呢，今天我们虽然还活着，但是对皇上又有什么裨益呢？”皇后和其他嫔妃想起董鄂妃的好处，感激董鄂妃过去的恩情，都吃素诵读经书，只有这样她们才觉得能足以报答您的情意啊。董鄂妃曾在宫中抚养承泽王的两个女儿，安王一个女儿，朝夕尽心抚养，慈爱不逊于自己亲生的。在董鄂妃崩时，这三个公主，都捶胸顿足十分哀痛，人们都不忍再听闻。
宫中庶务，以前都是董鄂妃来处理的，尽心检查审核，没有不恰当的。虽然位在皇后之下，却实权长期与孝惠后并存，且董鄂妃已经尽到了皇后的职责了。董鄂妃素来严谨恪守，热心地辅助内务，殚精竭力，无微不至，各项事务都非常勤勉努力。没有不周详的。董鄂妃崩后，皇太后伤心哀痛说：“我儿子的好媳妇儿啊，就是我的女儿啊。我希望能让他们二个人永续好合，好让我不要老得那么快，现在董鄂妃离去了，谁还能像她那样侍奉我啊？还有谁能如此顺我心意的呢？我有什么话，又同谁诉说啊？又能和谁一起谋划事务呢？”天下的臣民没有不感到悲痛的，皇太后、孝惠后和其他嫔妃都怀念追悼，只有顺治一个人，抚今追昔，虽然顺治说不出心中悲伤，悲痛却常常来袭。
董鄂妃崩后第三天，即八月二十一日，顺治谕礼部：“皇贵妃董鄂氏于八月十九日薨逝，奉圣母皇太后谕旨：‘皇贵妃佐理内政有年，淑德彰闻，宫闱式化。倏尔薨逝，予心深为痛悼，宜追封为皇后，以示褒崇。’朕仰承慈谕，特用追封，加之谥号，谥曰‘孝献庄和至德宣仁温惠端敬皇后’。其应行典礼，尔部详察，速议具奏。”
在礼臣们拟议谥号时，“先拟四字，不允。至六字、八字、十字而止，犹以无‘天’‘圣’二字为歉”。顺治为什么以无“天”“圣”二字为歉呢？因为清代谥法，皇后谥号的最后四字为“×天×圣”，“天”代表先帝，“圣”代表嗣帝，表示该皇后与先帝和嗣帝的关系。如孝庄文皇后在太宗时“赞助内政，既越有年”，以后又辅佐顺、康二帝。所以她的谥号最后四字为“翊天启圣”。而董鄂妃谥号的最后四字为“温惠端敬”四字，明显比有“天”“圣”二字的皇后低了一等，所以顺治感到内疚。顺治又命令上至亲王，下至四品官，公主、命妇齐集哭临，不哀者议处，幸亏皇太后“力解乃已”。顺治欲将太监、宫女三十名悉行赐死，“免得皇妃在其他世界中缺乏服侍者”，后被劝阻。并依据董鄂妃遗愿，下旨暂停当年秋斩。“是年命刑官减罪应秋决者，俱停刑，从妃志也。”
顺治十七年八月二十七日，董鄂妃的梓宫从皇宫奉移到景山观德殿暂安，抬梓宫的都是满洲八旗二、三品大臣。这在有清一代，不仅皇贵妃丧事中绝无仅有，就是皇帝、皇后丧事中也未见过。董鄂妃的梓宫移到景山以后，顺治为她举办了大规模的水陆道场，有一百零八名僧人诵经。整天铙钹喧天，烧纸施食，香烟燎绕，纸灰飞扬，经声不断。在“三七”日（第二十一天），将董鄂妃的尸体连同梓宫一同火化，由溪森秉炬举火。一起烧掉的还有两座装饰得富丽堂皇的宫殿，连同里面的珍贵陈设。火化后，将骨灰装入“宝宫”（骨灰罐）。十月初八日，皇帝第五次亲临寿椿殿，为后断七。
清制中平时皇帝批奏章用朱笔，遇有国丧改用蓝笔，过二十七天后，再用朱笔。而董鄂妃之丧，福临用蓝笔批奏章，从八月到十二月，竟长达四个月之久。顺治帝让学士撰拟祭文，“再呈稿，再不允”。后由张宸具稿，“皇上阅之，亦为堕泪”。为了彰显董鄂妃的贤德、美言、嘉行，福临命大学士金之俊撰写董鄂氏传，又令内阁学士胡兆龙、王熙编写董鄂氏语录。福临亲自动笔，饱含深情地撰写了《孝献皇后行状》，以大量顺治追悼董鄂妃的《御制哀册》、《御制行状》的具体实例，展现了董鄂妃的美言、嘉行、贤德，洋洋达四千言，内容涵盖甚广。
顺治身心遭到了极大的伤害，董鄂妃死后仅半年，顺治帝就得了当时的不治之症——天花。“妃既薨，帝忽忽不乐，自于宫中行年之丧，又亲制行状，述妃懿媺，以寄其哀。及崩，遗诏罪己始以丧祭逾礼自悔焉。”当时正直元旦，无论宫中与民间都张灯结彩准备欢度新年，就在这时皇帝病重的消息从宫中传出，朝廷传谕全国“毋抄豆、毋点灯、毋泼水”，并颁布大赦令，可是并无收效。在钦定皇三子即位、口述遗诏后，顺治皇帝于正月初七日半夜崩于养心殿，时年二十四岁。顺治皇帝驾崩后，尸体被火化，于康熙二年与孝康章皇后佟佳氏（康熙帝生母）、孝献皇后董鄂氏合葬入清东陵中的孝陵。
董鄂妃生前隆宠，死后盛荣，虽活得年岁很短，但无疑她在后宫这几年所得比起其他女子待在宫中一辈子所得要多得多。她与顺治的倾世绝恋，天下人尽知。所谓死能同穴，未尝不是件幸事。再者，对于顺治妇亡夫随，董鄂妃还须贪求什么？什么都不重要了，皇帝都能舍命相随，如此便够了！所以说，个人以为董鄂妃是清朝后妃最幸福的后妃了！